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sgRNA设计及活性检测虚拟仿真软件根据 CRISPR/Cas9 基因编辑技术的特点,利用计算机虚拟现实技术,通过三维重建和模拟实验等技术手段,建立了sgRNA设计及活性检测虚拟仿真软件。学生可通过该软件学习 CRISPR/Cas9 基因编辑技术的技术原理、应用范围,从而掌握这一最前沿的分子生物学实验技术。北京欧倍尔虚拟仿真的微博视频

CRISPR/Cas9基因编辑全流程详解 你知道CRISPR/Cas9技术吗?这是一种强大的基因编辑工具,能够在特定DNA位点进行精准编辑。今天,我们来详细讲解CRISPR/Cas9的原理和操作步骤,帮助你更好地理解这项技术。 𐟔 原理 CRISPR/Cas9技术的核心是CRISPR(成簇的规律间隔的短回文重复序列)和Cas9(CRISPR相关蛋白9)两种成分。CRISPR是一段特殊的DNA序列,用于记录病毒入侵的历史,并通过间隔序列存储病毒的DNA片段。Cas9则是一种核酸酶,能够在特定DNA序列上切割双链DNA。 在基因编辑过程中,研究人员首先设计一条与目标DNA序列互补的单链RNA引导分子(sgRNA)。这条sgRNA能够携带Cas9蛋白,通过碱基互补配对的方式精确找到目标DNA序列。一旦定位成功,Cas9蛋白就会在sgRNA的引导下切割目标DNA双链,产生DNA双链断裂(DSB)。 细胞在修复这些DSB时,可以通过两种主要机制进行:非同源末端连接(NHEJ)和同源定向修复(HDR)。在没有同源模板的情况下,NHEJ机制会被激活,导致目标基因被删除或产生插入/缺失突变,从而实现基因的敲除。而HDR机制则允许在DSB处外源DNA模板,实现精确的基因插入或替换。 𐟛 ️ 操作步骤 设计sgRNA 选择目标基因中的合适靶点序列。 使用专门的软件(如CRISPRDesign Tool)设计sgRNA序列,确保其具有高度的特异性和准确性。 制备sgRNA 通过体外转录技术或化学合成方法制备sgRNA。 验证sgRNA的纯度和完整性,通常使用凝胶电泳等技术进行。 构建CRISPR/Cas9系统 将Cas9编码序列和sgRNA序列克隆到适当的载体中,如质粒或病毒载体。 确保CRISPR/Cas9系统能够在细胞中稳定表达。 转染细胞 使用基因转染、电穿孔或病毒介导转导等方法将CRISPR/Cas9系统导入目标细胞。 根据细胞类型和转染效率选择合适的转染方法。 筛选和鉴定基因编辑细胞 使用特定的筛选标记(如荧光蛋白或抗生素抗性基因)富集成功转染的细胞。 通过分子生物学方法(如PCR和测序)验证目标基因的编辑情况。 筛选出具有目标基因敲除、插入或替换的细胞克隆。 功能验证 研究编辑后细胞的表型变化和功能影响,如细胞增殖、分化、迁移等。 使用流式细胞术、Western Blotting(WB)或免疫组化等技术检测目标蛋白的表达情况。 CRISPR/Cas9技术通过精确识别和切割目标DNA序列,结合细胞自身的修复机制,实现了对基因的敲除、插入或替换。其操作方法包括设计sgRNA、制备CRISPR/Cas9系统、转染细胞、筛选和鉴定基因编辑细胞以及功能验证等步骤。这一技术为基因编辑领域带来了巨大的变化,并在微生物工程等领域展现出广阔的应用前景。

CRISPR筛选引领遗传干扰研究的新浪潮

一分钟搞懂基因过表达、敲低、敲除的区别 嘿,大家好!今天咱们来聊聊基因操作里的三个常见术语:过表达、敲低和敲除。别担心,只需要一分钟,你就能搞懂它们的区别啦! 基因过表达 𐟚€ 基因过表达,简单来说,就是把一个基因插到一个表达载体里,然后把这个载体转染到目标细胞里。这样一来,细胞就会大量表达这个基因和它编码的蛋白质。常见的载体有哺乳动物载体(用于人、小鼠等哺乳动物细胞)、原核载体(用于大肠杆菌等原核生物)和慢病毒载体(比如HIV、FIV、SIV、EIA)。构建这些载体的方法包括设计目的基因片段和载体、连接元件(用酶切或gateway连接),然后通过病毒载体、电穿孔或转染试剂导入目标细胞。 基因敲低 𐟛‘ 基因敲低呢,主要是用抑制剂来抑制基因的表达。常见的方法有RNA干扰技术(RNAi)、CRISPR-Cas9技术和gene转染技术。比如,siRNA载体通过与目标mRNA互补结合序列,特异性地实现靶向mRNA降解。而CRISPR载体则包含CRISPR靶向序列和转录抑制子。构建这些载体的步骤包括设计干扰序列、合成和克隆、转化和筛选,最后通过病毒等途径导入目标细胞。 基因敲除 ✂️ 基因敲除则是用含有已知序列的小DNA片段与受体细胞基因组中序列相同或相近的基因发生同源重组,整合到受体细胞基因组中并得到表达的一种外源DNA导入技术。常见的载体有CRISPR/Cas9载体和TALENs载体。CRISPR/Cas9载体通过Cas9核酸酶和sgRNA靶向序列精确定位并靶向基因DNA序列,然后引入双链断裂点,完成基因敲除。而TALENs载体则包含特异性核酸酶和nuclease binding domain,通过切割靶向基因DNA序列,完成敲除和编辑。构建这些载体的方法包括设计和选择靶点、载体插入、转化和验证,最后通过病毒载体、电穿孔等方法导入目标细胞。 总结 𐟓 总的来说,基因过表达、敲低和敲除这三种技术在生物学研究中有着广泛的应用。了解它们的原理和构建方法,可以帮助你更好地设计和执行实验。希望这篇文章能让你在短时间内对它们有个清晰的认识!如果你有任何问题或需要进一步的解释,欢迎在评论区留言哦!𐟘Š

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